赵东宇 博士

研究员 博士生导师

威尼斯商人电影免费观看医学生物信息学系

实验室网站：https://www.labxing.com/med.bio_zhao

Email: zhaodongyu@bjmu.edu.cn

研究方向：

1）建立精准的疾病基因识别方法和开发相关生物信息学分析工具；

2）结合多组学数据研究疾病（主要是肿瘤、心血管）基因组变异和转录调控；

3）开发基于第三代纳米孔测序数据的分析软件。

个人简介：

威尼斯商人电影免费观看医学生物信息学系PI，分子心血管学教育部重点实验室PI。中国抗癌协会肿瘤测序及大数据分析专委会委员，中国运筹学会计算系统生物学分会青年理事，北京生物信息学研究会会员， Frontiers in Genetics期刊责任编辑。2013年获得中国科学院北京基因组研究所博士学位，曾在美国康奈尔大学休斯敦Methodist研究所、哈佛大学医学院波士顿儿童医院等机构从事博士后研究。2021年初回国加入威尼斯商人电影免费观看，现带领团队主要致力于疾病基因的遗传和表观遗传机制的计算模型研究。至今在Molecular Cell、Nature Communications（3篇）、Oncogene、Nucleic Acids Research等国际著名学术期刊上发表代表性学术论文20余篇。获得美国Moran Foundation学术奖励、2021年威尼斯商人电影免费观看教学基本功比赛二等奖、2021年威尼斯商人电影免费观看（医学类）青教赛三等奖等奖励。

科研项目：

1. 2021科技部国家重点研发项目：大型队列间联合研究柔性化大数据云平台支撑系统研发，2021.12-2024.11，课题骨干。

2. 2021威尼斯商人电影免费观看引进人才专项：表观遗传特征的胃部肿瘤驱动基因研究，2021.04-2024.03，课题负责人。

3. 2022威尼斯商人电影免费观看临床医学+X青年专项：新辅助免疫治疗微卫星不稳定亚型胃癌免疫微环境时空演化规律及其染色质开放性机制研究，2022.04-2022.12，共同课题负责人。

       4. 2022国家自然科学基金面上项目：基于多组学特征预测肿瘤驱动lncRNA及动态调控网络构建，2023.1-2026.12，课题负责人。

代表性论文：（# 并列第一作者）

1.  Dongyu Zhao#, Min Zhang#, Shaodong Huang, Qi Liu, Sen Zhu, Yanqiang Li, Weihua Jiang, Daniel L. Kiss, Qi Cao, Lili Zhang, Kaifu Chen. CHD6 Promotes Broad Nucleosome Eviction for Transcriptional Activation in Prostate Cancer Cells. Nucleic Acids Research, 2022,50(21):12186-12201.

2． Dongyu Zhao^#, Lili Zhang^#, Min Zhang, Bo Xia, Jie Lv, Xinlei Gao, Guangyu Wang, Qingshu Meng, Yang Yi, Sen Zhu, Alin S. Tomoiaga, John P. Cooke, Qi Cao^, Kaifu Chen^. Broad Genic Repression Domains Signify Enhanced Silencing of Oncogenes.  Nature Communications , 2020, 11(1): 1-14.

3． Bo Xia^#, Dongyu Zhao^#, Guangyu Wang^#, Jie Lv, Alin S. Tomoiaga, Min Zhang, Yanqiang Li, Xin Wang, Shu Meng, John Cooke, Qi Cao^, Lili Zhang^, Kaifu Chen^. Machine Learning uncovers cell identity regulator by histone code.  Nature Communications , 2020, 11: 2696-2708.

4． Sen Zhu^#, Dongyu Zhao^#, Chao Li^#, Qiaqia Li, Weihua Jiang, Qipeng Liu, Rui Wang, Ladan Fazli, Yinan Li, Lili Zhang, Yang Yi, Qingshu Meng, Wanyi Wang, Xiongbing Zu, Wei Zhao, Tuo Deng, Jindan Yu, Xuesen Dong, Kaifu Chen^, Qi Cao^. BMI1 is directly regulated by androgen receptor to promote castration resistance in prostate cancer.  Oncogene , 2019, 39: 17-29.

5． Shilpa S. Dhar^#, Dongyu Zhao^#, Tao Lin, Bingnan Gu, Khusboo Pal, Hunain Alam, Jie Lv, Vidya Gopalakrishnan, Wei Li, Ali Shilatifard, Roy V. Sillitoe, Kaifu Chen^, Min Gyu Lee^. MLL4 Is Required to Maintain Broad H3K4me3 Peaks and Super-Enhancers at Tumor Suppressor Genes.  Molecular Cell , 2018, 70(5): 825-841.

6． Sen Zhu^#, Dongyu Zhao^#, Lin Yan^#, Weihua Jiang, Jung-Sun Kim, Bingnan Gu, Qipeng Liu, Rui Wang, Bo Xia, Jonathan C Zhao, Gang Song, Wenyi Mi, Rong-Fu Wang, Xiaobing Shi, Hung-Ming Lam, Xuesen Dong, Jindan Yu, Kaifu Chen^, Qi Cao^. BMI1 regulates androgen receptor in prostate cancer independently of the polycomb repressive complex 1.  Nature Communications , 2018, 9(1): 1-13.

7． Yongbing Zhao^#, Chen Sun^#, Dongyu Zhao^#, Yadong Zhang, Yang You, Xinmiao Jia, Junhui Yang, Lingping Wang, Jinyue Wang, Haohuan Fu, Yu Kang, Fei Chen, Jun Yu, Jiayan Wu^ and Jingfa Xiao^. PGAP-X: Extension on pan-genome analysis pipeline.  BMC Genomics , 2018, 19(36): 115-124.

8． Dongyu Zhao^#, Jiayan Wu^#, Yuanyuan Zhou, Wei Gong, Jingfa Xiao^, and Jun Yu^. WikiCell: A Unified Resource Platform for Human Transcriptomics Research.  OMICS: A Journal of Integrative Biology , 2012, 16(6): 357-362.

9． Dongyu Zhao, Yan Wang, Di Luo, Xiaohu Shi, Liupu Wang, Dong Xu, Chunguang Zhou, Jun Yu， Yanchun Liang. PMirP: A pre-microRNA prediction method based on structure-sequence hybrid features.  Artificial Intelligence in Medicine , 2010, 49: 127-132.